普渡大学 信用:Pixabay/CC0公共域 像祖先这样的基因和祖先服务的流行
com和23andMe证明人们关心他们祖先的起源
潜在的假设是，一个人祖先的地理位置会影响他今天的基因
历史上，科学家们发现地理是人口遗传多样性背后的最大驱动力
现在，普渡大学的新研究表明，虽然这可能适用于欧洲国家，但不适用于世界上所有其他地方——尤其是像印度这样的地方，那里的语言和社会制度强烈影响着人们的生活方式和居住地点
研究人员开发的分析印度人口遗传学的模型将允许其他研究人员分析遗传学与地理联系不那么紧密的人口
理解人类群体的遗传学有助于科学家理解人类运动和文化的历史，并为理解人类健康和对疾病的易感性铺平道路
人口遗传学家、普渡大学生物科学副教授佩里特拉·帕斯丘研究了世界各地的人类基因变异，并与普渡大学计算机科学系副主任彼得罗斯·德里尼亚斯一起领导了这项研究
“我们的基因组带有我们祖先的特征，现代人口的遗传结构是由进化的力量塑造的
我们要寻找的是是什么导致不同群体的人走到一起，又是什么让他们分开
”帕斯科说
“为了理解人类群体的遗传学，我们创建了一个模型，允许我们联合考虑可能塑造遗传学的许多不同因素
将遗传学和计算机科学结合起来的跨学科研究是我们工作的关键，也是分析代表印度次大陆多样性的综合数据集的关键
" 许多人口分析主要依赖生活在欧洲或北美的欧洲血统个体的数据集；世界其他地方的人口基因组数据缺乏
来自欧洲样本的数据显示，遗传学与地理有着非常密切的关系:如果你知道某人的遗传学，你可以猜测他们来自哪里，在某些情况下在几公里之内，如果你知道某人的祖先来自哪里，你就有了他们基因组成的近似
亚里特拉·博斯在普渡大学获得了数据科学和遗传学的博士学位
在阅读关于欧洲基因组如何映射到地理的研究时，出生并在加尔各答长大的博斯想，“嗯
这在印度是行不通的
“印度是800多种语言和一个有着千年历史的种姓制度的家园，这个制度规定了谁可以和谁结婚，谁可以和谁生孩子
“我读了这些论文，我想，”在像印度这样的分层人口中，我如何使用这个概念？”博斯说道
“我在那里长大，我了解种姓和语言，以及影响遗传学的错综复杂的社会
" 以前对印度人口的研究表明，欧洲人口遗传学和地理学模型未能解释印度人口遗传学
Bose想知道他是否能想出一个模型来考虑影响印度人口的其他因素，包括种姓制度、文化和语言
这个模型，以及遗传学家和数据科学家团队使用它得出的结论，刚刚发表在《分子生物学和进化》杂志的一项研究中
他们的研究表明，在印度，共同的语言，而不是地理，是形成基因流动的最强大的力量
开发这个模型并不容易
早些时候，博斯的一些方程遇到了障碍，他向当时在IBM Research实习的导师提到了这个问题
与他的博士顾问和几位来自国际商用机器公司的计算机科学家一起工作，这个团队能够设计出一个健壮、灵活的模型
博思的博士顾问之一德里尼亚斯说:“在塑造印度大陆的人口结构时，遗传学和社会人口因素之间的相互作用引起了我的兴趣
令人兴奋的是，我们的模型发现口语是让印度人跨越地理和社会障碍走到一起的主要力量
我们有幸请到了我们的前博士生阿瑞特拉·博斯(与帕斯丘教授共同担任顾问)参与这个项目，因为他在我们研究的算法和人类基因方面都有广泛的背景，并有专业知识在印度人类基因多样性的背景下解释我们的发现
" 由此产生的模型是第一个能够考虑这么多不同变量的模型，它在分析印度人口的遗传学方面非常成功，让科学家们看到了印度人是如何进入印度的，以及不同群体是如何混合在一起的
说同一种语言——甚至相似语言——的人往往关系更密切，即使他们在地理上相距甚远
“它揭示了遗传学在我们社会中是如何工作的，”博斯说
“这是第一个考虑到影响人口基因流动的社会、文化、环境和语言因素的模型
这有助于我们理解是什么因素导致了印度这个基因难题
它解开了谜题
" 这些数据有助于将印度与全球其他国家的基因联系起来
说印欧语和德拉维甸语的印度人与欧洲人关系更密切，而说藏缅语族的印度人与东亚人关系更密切
这种类型的跨学科研究，将数据科学与群体遗传学配对，特别是这种模式，将有助于研究人员了解人类世界的遗传学，特别是具有丰富多样性和移民历史的非欧洲国家
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