物理科技生物学-PHYICA

一种新的感知一致性质谱虚拟修真时代成像可视化方法

化学 2022-07-21 00:02:29

斯科尔科沃科技学院 学分:斯科尔科沃科技学院 斯科特科学家提出了一种利用人类视觉独特特征的质谱成像方法

这项研究发表在《分析化学》杂志上

高分辨率质谱是一种分析技术,可精确测量电离过程中分子产生的离子质荷比(m/z)和离子信号强度(离子的相对数量)

这些测量允许确定分子的重量和结构,(通过将它们片段化),从而识别各种化合物,例如蛋白质、脂类、代谢物、肽、药物成分等

通过在样品的每个点(例如,肿瘤切片)使用分子的局部激光电离进行离子的质谱分析,质谱分析提供了关于组织中分子的空间分布的信息

解释MSI数据是一个相当大的挑战

首先,我们可以对组织切片表面的分子分布进行成像,并创建一个全彩色图像,其中每种颜色代表一个具有相似离子组成的点

因此,在每个点上具有相应强度的成千上万个离子应该仅由三个数值来表示,这三个数值最大程度地反映了MSI数据,并且与三维颜色空间相关联,以便研究人员能够进一步分析

“考虑到人类视觉的真实特征,如非线性和对亮度和颜色变化的不同敏感度,从图像中收集尽可能多的信息是至关重要的

虽然颜色感知理论从20世纪上半叶就开始研究了,但专家们仍然缺乏普遍接受的数学模型来准确解释人类视觉的所有已知特性,”主要作者安娜斯塔西娅·萨雷切娃(Anastasia Sarycheva)说

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学生解释道

斯科特计算和数据密集型科学与工程中心的研究人员

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哈尔克维奇信息传输问题研究所提出了一种新的微星方法,该方法利用了人类颜色感知的理论,并在细节层次上与现有技术相当

当叠加类似离子组成的区域时,新方法保留了边界和梯度

因此,得到的图像比其他多尺度分析可视化技术更容易解释

该方法已经在模拟和实验数据上进行了测试,这些数据是由斯科尔泰克质谱实验室的研究人员与斯科尔泰克神经生物学和大脑修复中心(CNBR)的生物学家共同获得的

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