范·安第尔研究所 信用:Unsplash/CC0公共领域 十多年来，研究表观遗传学的科学家使用了一种叫做ChIP-seq的强大方法来绘制蛋白质和其他关键调控因子在整个基因组中的变化
虽然ChIP-seq为健康和疾病的基础提供了宝贵的见解，但它也面临着令人沮丧的挑战:它的结果通常被视为定性的而不是定量的，这使得解释变得困难
但是，根据最近一份被《生物化学杂志》选为编辑精选并刊登在封面上的报告，芯片序列可能一直是定量的
“ChIP-seq是表观遗传学研究的支柱
我们的发现挑战了需要额外的步骤才能使其定量的信念
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范·安第尔研究所的科学家和该研究的相应作者
“我们的新方法提供了一种量化结果的方法，从而使ChIP-seq更加精确，同时不影响标准方案
" 之前对芯片序列结果进行量化的尝试导致了该方案增加了额外的步骤，包括使用“尖峰蛋白”，这是一种添加剂，旨在使芯片序列结果正常化，并揭示组蛋白的变化，否则可能会被掩盖
这些额外的步骤增加了实验的复杂性，同时也增加了可能干扰重现性的变量
重要的是，这项研究还发现了一个以前没有讨论过的峰值归一化的敏感性问题
迪克森和他的同事使用一种预测性物理模型，开发了一种新的方法，称为定量芯片测序的无尖峰方法，或siQ-ChIP
它使研究人员能够遵循标准的芯片序列方案，消除了对尖峰信号的需要，还概述了一套应报告给所有芯片序列实验的通用测量方法，以确保重复性和量化
通过利用免疫沉淀步骤中的结合反应，siQ-ChIP为测序结果定义了一个物理尺度，允许在实验之间进行比较
定量标度基于免疫沉淀产物的结合等温线
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