地理图揭示了基于中国和欧洲的病毒变种进入西非国家的不同模式(直到2020年4月)
学分:德国杜塞尔多夫海因里希-海涅大学 在新型冠状病毒疫情疫情爆发之初，人们担心疫情会淹没许多非洲国家薄弱的卫生系统
然而，与非洲相比，欧洲和美国的发病率和死亡率要高得多
其原因可能在于相对年轻的人口、以前的病毒感染和温暖的气候
然而，新型冠状病毒影响了所有非洲国家，因此发起了在全球分发疫苗的倡议
在大多数国家，病毒分离株的基因组是连续测序的
可以对DNA序列进行系统发育分析，以确定病毒变异的起源，并监测新变异的发展和分布，新变异可能更温和，或者在最坏的情况下更致命
杜塞尔多夫海因里希-海涅大学的研究人员在对西非国家——冈比亚、加纳、尼日利亚和塞内加尔——的病毒序列进行系统发育分析时，揭示了新型冠状病毒变异的独特模式
教授
博士；医生
詹姆斯·阿德杰是这项发表在《科学报告》上的研究的资深作者
生物信息学家沃斯科·瓦鲁克是这篇论文的第一作者
尽管四个被调查的国家有相似的地理和气候条件，研究人员发现了不同的病毒变异模式
这可能反映了一种被称为“创始人效应”的遗传漂变机制，在这种机制中，遗传多样性仅由形成新的独立群体的一小部分群体驱动，例如将病毒变种从法国传播到塞内加尔的特定感染者
“当你观察病毒变异的不同模式时，你可以直接看到历史关系
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塞内加尔曾是法国的殖民地，与法国的模式相似，因为塞内加尔和法国之间仍有大量的交通和贸易往来
加纳和尼日利亚都是前英国殖民地，病毒模式相似
这两个国家都与欧洲和中国有贸易和劳工联系，”海因里希-海涅杜塞尔多夫大学医学院的加纳-英国教授、干细胞研究和再生医学研究所所长詹姆斯·阿德杰说
Wruck补充道，“令人惊讶的是，我们发现来自欧洲的晚期变异体比早期变异体更早被发现
对此的解释可能是早期的病毒变异体潜伏传播，而后期的变异体由于病毒传播性更高而更早被发现
" 由于新型冠状病毒病毒是一种核糖核酸病毒，当核糖核酸在人体宿主细胞内复制时，就会发生突变
在系统发育分析中，指向相似起源的相似突变模式聚集在一棵树的分支中，如果它们足够大，可以被称为变异
突变可能没有效果，也可能导致氨基酸取代，从而改变病毒蛋白质的功能或结构
教授
Adjaye和他的同事从GISAID数据库下载了来自四个西非国家的新型冠状病毒序列，并以中国、欧洲和美洲的序列作为参考
通过系统发育分析，这些序列可能与病毒变异体相关，此外，每个国家都可以检测到不同类型的病毒变异体
在2020年4月的第一阶段研究中，最突出的氨基酸替代是天冬氨酸(D)被病毒刺突蛋白内614位(D614G)的甘氨酸(G)改变(由RNA突变A23403G引起)
Wruck表示，“我们看到D614G在2020年4月逐渐取代了其他变体
2021年6月，它取代了它们，并被包括在所有新的变体中，如α和δ
2021年10月，delta变体占据主导地位，未来的问题将是delta的哪个子变体将占上风？“delta变体的传播具有进化优势，因为氨基酸替代导致群体内更高的传播
瓦鲁克评论道:“2020年4月，我们只能检测到少数似乎源自西非的罕见突变，2021年6月，出现了源自尼日利亚的埃塔(η)变种。”
Adjaye补充说，“需要对病毒序列进行持续监测，以控制新变种的传播，并评估疫苗效力
然而，对于未来的治疗，更好地理解COVID19的潜在机制也是至关重要的，正如我们在早期的出版物中所做的那样，该出版物阐明了肺细胞中新型冠状病毒感染引起的分子变化
肾脏是第二个受影响最严重的器官，有报道称感染新冠肺炎病毒的成年人出现了急性肾损伤(AKI)和肾功能突然丧失
我们目前正在将实验室生产的刺突蛋白(这是目前疫苗的基础)引入从尿液样本中分离出来的人类肾细胞
这项工作将阐明与细胞因子风暴、细胞损伤和肾损伤相关的基因和药物途径
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