由冲绳科技学院Kuruma虾在日本被认为是一种美味的信用:OIST来自冲绳科技学院研究生院的新研究(OIST )和东京海洋科学和技术大学已导致Kuruma虾的遗传资源有益
这些是大虾最大的物种之一(女性能够达到27厘米),并在整个印度人身上找到太平洋
在日本,他们被认为是一种美食ACY并成为20世纪初以来的主要渔业和水产养殖产品(特别是在冲绳)但是虾农场的一个大问题是动物的高密度意味着疾病迅速传播
疾病的一种是一种称为白斑病的病毒感染,这是虾水产养殖的最威胁性的病原体之一
是致命和高度传染性的;爆发只在几天内擦掉整个农场
“我们对重新感兴趣水产养殖动物和病毒相关细菌和病毒之间的语言,“解释的博士
eiichi shoguchi,oist中的海洋基因组学单位的群体领导者
”“手上的遗传资源可能是有用的为了产生虾的抗性线或疫苗
“”由OIST的DNA测序部分支持,研究人员使用了两种不同的技术 - 基因组测序和转录组测序 - 以产生该遗传资源
他们的作品发表于G3:基因组L Genemes L Genetics
基因组是在每个细胞中发现的全套遗传信息将其细分为基因
这些基因由DNA碱基对组成,每种基因含有产生蛋白质所需的说明,因此leaDS对细胞
对要进行的指令进行适当的护理和维持,必须首先将DNA转录成RNA
转录组是所有这些基因读数的集合
在某种程度上,转录组可以被认为是基因组的反射
一些基因可能与抗病抗性有关,并且一些个体可能含有这些基因的变化,导致耐抗性更强的抗性如果可以鉴定这些基因,则可以建立虾的抗性线
Kuruma虾是冲绳的重要水产养殖产品,仅次于Mozuku海藻
信用:卫生店首先,研究ERS专注于解密该基因组
它们从冲绳的商业农场服用了一只Kuruma虾,并产生了初始序列
这产生了许多短的DNA序列,虽然有用,但没有提供具有足够线索的研究人员将它们串在一起
基本上,他们有一个拼图的所有拼图,但没有办法组装它
他们然后使用第二种技术来产生更长的,但更确切地说, DNA序列 - 基因组的支架
通过使两个序列使它们能够组装基因组的草稿
在此之后,研究人员分析了49个不同的虾仁(包括成人和幼虫)的RNA样品
这提供了66,406个高质量的基因读出 - 转录组的草稿
“ Kuruma Shrimp Genome为我们提供了一种综合性免疫相关基因目录,“MR
Satoshi Kawato,纸的铅作者和pH
D
学生东京海洋科技大学基因组科学实验室
“这将使我们更好地了解虾如何应对病原体,并有助于制定预防疾病爆发的策略
基因组资源还将有助于解决虾Biolo的各种其他方面GY,如生长和生殖
“当他们的工作与Kuruma虾的亲属 - 巨大的老虎虾和白杆菌虾 - 近70%基因相比,在所有三种物种上都是相同的,意味着大量的基因已经保留了
“我们认为这将作为未来研究理解虾基本生物学的有用资源,”博士
Shoguchi
“但它也可以用于渔业管理,并建立育种计划
”
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