中国科学院李源 人类细胞核中HBV脱氧核糖核酸的空间组织模型
学分:博士
杨鹏远的小组 乙型肝炎病毒(HBV),一种小的有包膜的脱氧核糖核酸病毒,属于肝素病毒家族,仍然是一个严重的全球健康问题
不受控制的慢性HBV感染可导致危及生命的终末期慢性肝病,如肝硬化和肝细胞癌
人类核HBV脱氧核糖核酸,包括共价闭合的环状脱氧核糖核酸和整合的HBV脱氧核糖核酸,被认为是HBV相关肝病发展和进展的主要贡献者
教授
中国科学院生物物理研究所(IBP)杨鹏远教授
北京大学生命科学学院的熊吉强调了核HBV脱氧核糖核酸在人类细胞中的关键作用,并研究了HBV脱氧核糖核酸如何与人类染色质相互作用
他们的研究发表在12月7日的《细胞发现在线》上
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研究人员首先采用了一种高度敏感的技术——3C高通量全基因组易位测序法(3C-HTGTS),在HBV感染的细胞模型中对HBV DNA-宿主DNA接触进行全球鉴定
有趣的是,HBV基因并没有在宿主基因组中随机定位,而是优先在活跃的染色质区域与宿主基因建立联系
重要的是,来自3C高温气冷实验堆的数据揭示了另一种HBV DNA,整合的HBV DNA,可以在人类基因组的转录活性区与宿主基因组DNA形成染色质环
基于对HBV DNA-宿主DNA接触的鉴定,研究人员发现在HBV cccDNA小染色体中也观察到了由KMT2C/D修饰的H3K4me1标记区域,并强烈影响HBV转录
此外,HBV病毒感染影响宿主基因表达,伴随着HBV病毒与宿主的接触
这些发现为人类基因组中的cccDNA和整合的HBV DNA的空间组织提供了高通量的三维景观,并为进一步理解HBV调节肝脏疾病发展和进展的机制奠定了基础
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