物理科技生物学-PHYICA

公开土壤呼吸数开新车了据

地球 2022-05-15 00:00:08

贝丝·蒙迪,太平洋西北国家实验室 信用:太平洋西北国家实验室 从艰苦的实地活动中收集数据集似乎比从不同的活动中寻找和比较数据更困难

不幸的是,情况往往并非如此

据太平洋西北国家实验室(PNNL)地球科学家金士健说,“收集数据集进行比较是一项困难而耗时的工作

单位、惯例、术语——许多事情可能会以令人困惑的方式变化

“付费墙后面的数据也可能无法访问或无法下载

这些问题在大多数领域都存在,但是研究人员之间的合作,通过自动化系统测量土壤和大气之间的气体交换,也称为土壤-大气通量测量或土壤呼吸,正在将他们的领域推向解决方案

了解进入和离开土壤的气体水平是如何随着大气的变化而变化的,对于全面了解全球碳循环的演变以及由此导致的气候变化至关重要

实地测量的数据集通常侧重于高度特定的地理区域,并存在广泛的格式兼容性问题,但将它们拼接在一起以创建更具全球性的数据集可以提供广泛的生物地球化学见解

为了推动科学向前发展,来自70多个机构的一个全球研究小组为COSORE(Continuous SoFtware的缩写)数据库做出了贡献,其目标是创建一个广泛的资源,其中包含来自世界各地的标准化土壤通量数据集,这些数据集已被转换为对研究人员有用的形式

在PNNL的本·邦德-兰伯蒂的努力下,COSORE上个月推出了800多万个数据点

根据邦德-兰伯蒂的说法,研究团体的成员已经对这个项目感到兴奋

创建一个可用的数据库需要全球70多个机构的研究人员的合作

学分:本·邦德-兰伯蒂|西北太平洋国家实验室 为学生和研究人员创建一个可访问的包 十年前,邦德-兰伯蒂致力于一个类似的项目,并创建了一个年度通量测量数据库(土壤呼吸数据库或SRDB),该数据库自成立以来一直被广泛使用

SRDB的创建为数据库设计和大型数据仓库的有用性提供了宝贵的经验,这在构建COSORE时形成了他的哲学

COSORE的创作过程相当迅速

邦德-兰伯蒂在大约18个月的时间里把这个想法从构思到出版,对于这样一个大项目来说,这是一个快速的转变

“建设COSORE的一个指导理念是使其强大和高质量,但也不要让完美成为好的敌人

我想确保这个包对具有一系列统计和编程技能的科学家来说是可用和可访问的,”邦德-兰伯蒂说

今年夏天,COSORE的可用性受到了考验

邦德-兰伯蒂和一个高中实习生一起工作了一个夏天,他用这个包检查土壤-大气气体通量的温度敏感性,特别注意基于位置和昼夜周期的差异

COSORE拥有来自全球不同地区的数据集,包括北美、西欧和中国,允许用户比较这些地区的趋势

信用:本·邦德-兰伯蒂| PNNL 新研究方向的社区知识库 COSORE的一个特别优势是它创造了新的研究可能性

它拥有的许多数据集非常专业,以至于只有一小部分研究人员会对它们感兴趣

然而,通过结合这些数据集,COSORE允许用户比较全球不同地区的趋势,有可能提供独特的新见解

扩大可用数据集的数量只是COSORE的一个好处

拥有一个中央存储库有助于保护科学领域不丢失流量数据,即使底层数据通过中断的存储和电子邮件链消失

最后,COSORE有望通过节省研究人员组装不同数据集的时间和精力来加速科学发展

邦德-兰伯蒂希望随着研究人员向数据库提交更多模板化数据,COSORE将继续增长

来自北美、西欧和中国的数据集占据了数据库的主导地位,在重要的热带地区留下了空白

随着来自重要地区的新数据集的收集,COSORE可以让世界各地的研究人员使用它们,他们可以利用这些资源来推动他们的科学进一步发展

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